El Curso Teórico-Práctico “Ecología Microbiana en la Era Omica” fue coorganizado con la Dr. Verónica Molina (Proyecto FONDECYT Reg. N° 1171324). El curso correspondió a una unidad de aprendizaje teórico/practico orientado a estudiantes de postgrado e investigadores postdoctorales y profesionales relacionados al área de Ecología Microbiana y Biotecnología, y tuvo como objetivo general robustecer las bases fundamentales de la ecología molecular para el estudio de comunidades microbianas en el ambiente. En particular, el curso exploró la generación de criterios comunes para el entendimiento de cómo funcionan los microorganismos de manera individual como también como parte de las comunidades y cómo las funciones microbianas se adaptan a las funciones del ecosistema. En general, las herramientas utilizadas con mayor frecuencia en estudios de ecología microbiana incluyen caracterizaciones moleculares (secuenciación de ADN, ARN, lípidos y proteínas), mediciones fisiológicas (producción de CO2 y gases trazas, medidas de biomasa, recuentos de células) y bioinformáticas (análisis estadístico y modelado). Nuestro curso se enfocó en entender los alcances y limitaciones de algunas de estas herramientas con el objetivo de generar criterios comunes y pensamiento crítico relativo a la selección de aproximaciones diferenciales para responder preguntas científicas, y aprender nuevas técnicas o construir nuevas herramientas cuando sea necesario.